比较项目
化学合成
体外转录
RNase III降解dsRNA
siRNA表达载体
PCR表达框
材料需求
21-mer RNAoligos(一对)
29-mer DNA oligos(一对)
转录模版 (200-1000bp，两侧带T7 启动子)
55-60-mer DNA oligos(一对)
~50-mer DNA oligos(一对)
全部制备/合成时间所需时间
4天—2周
24 小时 + DNA oligo合成时间
1 天 + 转录模版制备时间
5天以上 + DNA oligo合成时间
~ 6 小时 + DNA oligo合成时间
个人所需操作时间
几乎不需要*
中等
多
是否需要验证和寻找最有效siRNA
需要
不需要
能否标记siRNA (例如用于荧光显微镜分析siRNA进入细胞过程或者在细胞中的定位）
能
不能
转染的相对难易程度
好
差
可筛选性 (例如抗生素筛选)
不可以
可以
能否用于长效抑制
可以（抗生素筛选）
能否大规模制备
有限
检测总体转染效率
每个基因的相对费用（不包含人力）
高
低
*取决于合成后是否包含纯化、去保护，以及厂家提供的是已经退火的即用型双链还是冻干的单链